历史学科是学校进入新世纪之初在大力发展文科的宏大背景下组建的新兴学科，也是华中科技大学最年轻的一个学科门类。
该学科组建于2001年初，由著名历史学家、原西北大学校长张岂之教授出任历史研究所所长，原华中师范大学历史文化学院副院长、北京大学历史学博士罗家祥教授以及黄岭峻博士出任副所长。同年6月，在校党委副书记刘献君教授的主持下召开历史研究所成立大会，近50名历史学界著名专家学者云集学校，共庆学校历史研究所成立，一个崭新的学科门类在华中科技大学校史上正式诞生。
在短短几年时间内，在学校各级领导、各有关职能部门的热情关心、支持和有力扶持下，历史研究所切实贯彻落实学校采取超常规措施，实现跨越式发展的学科建设方针，遵照学校关于建设华中科技大学的总体战略构想，力图贯彻学校建立该学科的初衷，注重不失时机地引进高级专门人才，从而使学校历史学科从无到有，由弱到强，不断成长壮大，呈现出良好的发展势头。
2003年，历史研究所即已拥有教授4名，讲师4名。其中博士研究生指导教师1名，硕士研究生指导教师11人，具有博士学位者10名，初步形成一个结构较合理、实力较雄厚的学术群体。在建所当年即已获省学位办立项建设硕士点的基础上，历史学科于2002年提前招收攻读硕士学位研究生，2003年正式获得专门史硕士学位授予权，并开始大规模招收该专业硕士研究生。由于学校历史学科呈现出良好的发展势头，并在湖北地区和国内学术界确立了学术地位，2003年10月，学校历史学科被湖北省历史学会确定为常务理事单位，罗家祥教授当选为省历史学会副秘书长、常务理事，雷家宏教授当选为理事。截至2009年6月，研究所共有教职工13人(张岂之教授于2003年离任)，包括兼职教授2人，在岗教师10人，行政人员1人。其中博士研究生指导教师2人，硕士研究生指导教师7人，具有博士学位者9人，1人兼任教育部历史学科教学指导委员会委员。
